El Subfilo Hemichordata es compuesto de animales con notocordio que persiste durante el estado adulto pero no es a lo largo del cuerpo sino reducido. A estos animales se les llama por Hemicordados. Este subfilo se estudia en las siguientes Clases:

El Subfilo Cephalochordata, también llamado Tunicada, es compuesto de animales con notocordio sólo durante su estado larvario. A estos animales se les llaman los Urocordados y se estudian en las siguientes Clases:

El Subfilo Cephalochordata es compuesto de animales con notocordio a lo largo de todo el cuerpo y persistente durante toda su vida, pero carecen de columna vertebral. En total hay un par de docenas de especies, todas en el género Branchiostoma, antes conocido por Amphioxus, representando este filo.

Este es el subfilo, también llamado Craniata de los Vertebrados. Es en este subfilo donde se asocian los peces, anfibios, reptiles, aves y mamíferos. Se divide el subfilo en dos Superclases, las cuales se separan en Clases: